Por la cercanía de Mutxamel a Alicante, la orden religiosa de San Francisco de Paula funda una congregación en 1605. Destaca un claustro con arcos de cantarería, decorado con lienzos en los ángulos que narran los milagros de San Francisco de Paula; y, un aljibe.
Posteriormente, en 1642, se construye la iglesia. Esta orden permaneció en este municipio hasta la desamortización de Mendizábal (1835). A partir de este momento, el conjunto arquitectónico comienza a degradarse hasta tal punto que, gracias a las aportaciones de los vecinos, se restaura a mediados del siglo pasado. Tras esta intervención, el convento es ocupado por las monjas de la orden de las Mercedarias de la Caridad que abren una guardería a mediados de los años 70. Actualmente, no acoge a ninguna comunidad y solo se oficia misa en la iglesia.